1、 板式超高温杀菌设备（杀菌机）设备安装好后：
在生产使用前应拆开板式换热器各换热段和物料泵、平衡槽、气动回流阀等所有物料经过的管路与零部件，用碱水棕刷仔细洗干净后，根据流程图和顺序号进行装配组合，压紧至拆开前原来尺寸（拆开前须用卷尺记下各段的尺寸），预压时不能压得太紧，压紧尺寸参照流程图上的参数。
2、 板式超高温杀菌设备（杀菌机）生产使用前：
在平衡槽内放入冷水代替物料，加热到80℃左右，循环15分钟，对板片及管路进行全面预清洗。
3、 板式超高温杀菌设备（杀菌机）清洗完毕后：
要对管路及板片进行全面消毒，此时应把主令开关一置于回流位置，主令开关二置于消毒位置。然后调节相应的阀门，加热至137℃左右，循环20分钟，而后冷却到与物料进温一致，排除冷却高温水，送入物料，直至物料流出后，开始正常生产。
4、 板式超高温杀菌设备（杀菌机）生产完毕后：
（1） 用清水将设备中残留的物料顶出，直到排出之水无物料痕迹。
（2） 用1.5-2%氢氧化钠溶液加热至75℃-85℃循环20分钟，再用清水冲洗，使碱液全部顶出。
（3） 用1-1.2%硝酸溶液加热至70℃-75℃循环20分钟，再用清水冲洗，使酸液全部顶出。
5、 板式超高温杀菌设备（杀菌机）维护与保养的好坏，直接关系到设备使用的效能，尤其是作为高效能换热的板式换热器，更应注意日常的清洗和除垢，使其传热效率得以充分发挥。一般情况下，热水温度高于杀菌温度5℃为正常，如热水温度升高很多，则说明板片已结垢，必须停机清洗。根据使用情况，每隔一星期到一个月拆开板式换热器个换热片观察清洗是否有效，如用棕刷刷洗困难，可使用淡硝酸溶液处理之，再用清水冲洗干净，设备不使用时，压紧装置应放松。需要特别指出的是，蒸汽和压缩空气的清洁程度，直接关系到调节阀门（如减压阀、蒸汽调节阀）的工作好坏。蒸汽或压缩空气中过多存在垃圾或水份，会导致调节阀门不工作。